Homeopatsko lečenje može biti i preventiva, pogotovo ako se s njom započinje još od detinjstva. Homeopatija može delovati kao istinski preventivni lek, u organizmu koji će oboleti, pre nego što se pojave i funkcionalni simptomi koji nagoveštavaju bolest koja će se razviti.
Ovo razdoblje inkubacije je najprikladnije za homeopatsku intervenciju. Homeopatija istražuje telo puno pre pojave patoloških anatomskih lezija i prepoznaje predispozicije.
Dakle, istražujući pacijenta u celini, ona je u mogućnosti da vrati ravnotežu u organizam koja počinje da se narušava.